绍兴市档案馆前身是绍兴地区档案馆，成立于1979年3月，1984年11月更名为绍兴市档案馆。绍兴市档案馆是我市唯一的一家国家综合性档案馆，1998年晋升为省一级馆。2010年7月晋升为国家一级档案馆。2015年12月建成全国首批国家级示范数字档案馆。2019年12月通过首轮浙江省县市级国家级综合档案馆业务建设评价。

截至2023年年底，馆藏全宗589个，档案共1169299卷、834486件，馆藏资料44138册。馆藏档案主体为1964年以后绍兴市(地区)党政机关、群众团体和企事业单位的档案。馆藏较为珍贵的有形成于崇祯年间(1628-1644年)《绍城观巷金氏节孝承恩碑》、民国5年(1916年)的绍萧塘闸水利幸存史料和一批家(宗)谱、书法作品、名人档案等。

近年来市档案馆着力于丰富馆藏，改善结构。截止到2023年年底，已保管了市区2997卷、170357件婚姻档案，形成了市区婚姻档案保管和出证中心;已接收了市区100多家原国有、集体转制(破产)企业档案30余万卷，形成了  绍兴市工商企业档案保管和查询中心；从2011年开始，已全面接收市区企业退休人员档案6万7千余卷。经过系统整合，积累了比较完整的婚姻档案、户粮档案、公证档案、学籍档案、房产纳税档案和新闻照片档案等特色档案馆藏群。